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CHO-Zellen sind die wichtigen Wirtszellen, bei denen die Sekretion von Proteinen in ihrem nativen Zustand routinemäßig möglich ist. Obwohl das Genom vieler CHO-Zellen in den vergangenen Jahren sequenziert wurde, gibt es immer noch wenige Information über das Proteom von CHO-Zellen. Um ein besseres Verständnis über die Proteine von CHO-Zellen zu erlangen, wurde hier eine vergleichende Proteomanalyse der CHO-Zelllinien mittels 2D-GE und MALDI-TOF/TOF durchgeführt. Die Proteom-Forschung befähigt uns die unterschiedlich regulierten Proteine in CHO-Zelllinen zu identifizieren und die biologischen Funktionen zu klären. Aus diesem Grund wurde eine optimierte 2D-GE Methode im Rahmen dieser Arbeit für die Protein-Trennung der CHO-Zellen entwickelt.