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La industria farmacéutica basada en la investigación se ha enfrentado a crecientes desafíos en los últimos años como resultado de las crecientes presiones económicas y regulatorias. El aumento de los costes de la atención sanitaria, la creciente presión sobre los precios por parte de las organizaciones de atención médica gestionada, los controles de precios internacionales, la rápida aparición de productos genéricos (o la competencia dentro de una clase terapéutica) en el mercado y las políticas reguladoras más estrictas han obligado a las empresas farmacéuticas de investigación a perfeccionar y acelerar sus procesos de descubrimiento de fármacos. El proceso de descubrimiento de fármacos es básicamente una ciencia orientada al paciente, en la que los investigadores se esfuerzan por mejorar los fármacos existentes o inventar una entidad química totalmente nueva, que debería ser idealmente más potente que cualquier fármaco existente de una categoría similar. El desarrollo de nuevos fármacos con potenciales aplicaciones terapéuticas es uno de los procesos más complejos y difíciles. Se dedican millones de capital y horas de trabajo al descubrimiento de nuevos agentes terapéuticos. La intervención de los ordenadores en algunos pasos plausibles es imprescindible para reducir el coste y el tiempo necesarios en el proceso de descubrimiento de fármacos.