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La microbiología contribuye a la formación del Farmacéutico, con conocimientos sobre bacteriología, parasitología, micología y virología que al integrarlos con la inmunología, le permitirán realizar técnicas de identificación y diagnóstico en el laboratorio. Actualmente se han presentado moderados índices de reprobación y deserción en los módulos citados, lo que motivó la necesidad de conocer la percepción que tienen los alumnos sobre las actividades prácticas de estos módulos mediante la construcción de un instrumento ex profeso que incluye ítem en escala de Likert y abiertos; se realizaron algunas pruebas estadísticas utilizando el programa estadístico SPSS versión 21.0. Los resultados del instrumento aplicado a 224 alumnos en cuanto a validez, confiabilidad y pertinencia son buenos. Los factores más importantes para los alumnos son los aspectos pedagógicos de los docentes, la relación interpersonal, su nivel de actualización, la forma de enseñanza y la asesoría que prestan; además los alumnos mencionan que algunos profesores demuestran capacitación y experiencia, sin embargo, podrían mejorar su actitud para el mejor desarrollo académico, entre otras sugerencias.