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L'enseignement de l'évolution du vivant en Tunisie a un statut scientifique précaire. Il se fait dans un contexte socioculturel concordiste, interfère avec les croyances religieuses des élèves dont la formation méthodologique scientifique est déficiente. Les élèves conçoivent une équivalence argumentative entre référentiels argumentatifs scientifique et théologique. Une innovation est proposée en Tunisie pour militer au statut scientifique de l'enseignement de l'évolution. Le dispositif d'enseignement contextualisé, traite d'obstacles au statut scientifique de l'évolution par des réflexions épistémologiques en débats de classe. Ces réflexions accompagnent une construction de savoirs méthodologiques de la démarche de l'enquête et de savoirs conceptuels de l'évolution. L'objectif est d'aider les élèves à comprendre le statut scientifique de l'évolution, en tant que science historique. L'innovation est conçue, mise à l'essai et évaluée. Les résultats montrent que les discours distanciés, incités par les interventions en médiation de l'enseignant, ont aidé les élèves à déstabiliser et à identifier les obstacles afin de caractériser le référentiel scientifique de l'évolution.