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El arroz (Oryza sativa) es el cultivo alimentario más importante del mundo y la principal fuente de alimento para más de un tercio de la población mundial. La superficie de cultivo del arroz en la India es la mayor del mundo. La India posee una inmensa riqueza de germoplasma de arroz aromático y razas de tierra que muestran una amplia variabilidad con respecto a sus características morfofisiológicas, agronómicas, de grano y de cocción. Los marcadores moleculares se clasifican generalmente en (i) marcadores basados en la hibridación (no PCR) y (ii) marcadores basados en la PCR. Los marcadores basados en la hibridación implican la digestión por restricción y la hibridación de los fragmentos de ADN restringidos a una sonda etiquetada, como en los RFLP y los VNTR, mientras que los marcadores basados en la PCR implican la amplificación del ADN aislado. ). Estos marcadores basados en la PCR son técnicamente sencillos y sólo requieren una pequeña cantidad de ADN.