A biodiversidade é essencialmente composta pela diversidade genética. De facto, é necessário manter os recursos genéticos para assegurar a evolução das populações vegetais e animais naturais. Atualmente, com as mudanças nas condições ambientais, a adaptação e resistência das espécies locais deve ser estudada, especialmente nas cucurbitáceas, que são importantes para o consumo humano. O principal objetivo deste estudo é caracterizar a variabilidade genética das populações Cucurbita maxima tunisinas para manter as adesões locais. Uma avaliação in-situ desta coleção de abóboras resultou em um mapeamento e destacou uma grande diversidade morfológica entre frutos e sementes das principais áreas de produção. O estudo agromorfológico da abóbora recolhida, através dos descritores UPOV e IPGRI, revelou um elevado polimorfismo. O teor total de fenol e a capacidade antioxidante das sementes de abóbora eram elevados. A diversidade genética medida a partir de marcadores RAPD, ISSR e SRAP permitiu o desenvolvimento de uma árvore filogenética usando técnicas UPGMA e STRUCTURE.