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O arroz (Oryza sativa) é a cultura alimentar mais importante do mundo e uma fonte alimentar primária para mais de um terço da população mundial. A Índia é um dos centros originais de cultivo de arroz. A área de colheita do arroz na Índia é a maior do mundo. A Índia possui uma imensa riqueza de germoplasma aromático de arroz e raças terrestres exibindo uma grande variabilidade no que respeita às suas características morfofisiológicas, agronómicas, cerealíferas e culinárias. Anteriormente, um grande número destas variedades era colectivamente conhecido como Basmati (bas = aroma). Os marcadores moleculares são geralmente classificados em (i) baseados na hibridação (não baseados em PCR) e (ii) marcadores baseados em PCR. Os marcadores baseados na hibridação envolvem digestão de restrição e hibridação dos fragmentos de ADN restritos a uma sonda rotulada, tal como nas RFLPs e VNTRs, onde como marcadores baseados na PCR envolve a amplificação de ADN isolado. ). Estes marcadores baseados em PCR são tecnicamente simples e requerem apenas uma pequena quantidade de ADN.