Le VIH a une diversité génétique qui est égale à la complexité de sa prise en charge. Le Groupe M (Major) est le groupe dominant en Afrique Centrale. La distribution de ce groupe en Afrique et en République Démocratique du Congo (RDC), en particulier, est très hétérogène; elle suit un algorithme complexe et spécifique. Cette distribution est très dynamique, évolutive et imprévisible; elle continuera à se diversifier aussi longtemps que le virus circulera. La distribution géographique des variantes du VIH-1 en RDC est aussi étroitement liée à la distribution des variantes dans les pays voisins. Dans les pays voisins du Nord-Est, les souches prédominantes sont D, C, A et B. Tandis que dans les pays voisins du Sud-Est, les souches dominantes sont A, C et D. A Kinshasa, comme à travers le pays, elle est une véritable mosaïque, elle est différente selon les provinces. À travers les années, certains sous-types se sont confirmés alors que d'autres se sont effacés dû à la pression et différentes sélections. L'épidémie moléculaire du VIH-1 à Kinshasa suggère une persistance du sous-type A et une augmentation significative du CRF02_AG dans la population générale à travers les années.