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La coloration de Giemsa est une coloration métachromatique en ce sens que de nombreux tissus/organismes se colorent différemment de la couleur du colorant lui-même. Le mélange de colorants - bleu de méthylène, azur et composés d'éosine - est bleu, mais la coloration positive est désignée par une teinte violacée. Le Giemsa est fréquemment utilisé pour identifier les mastocytes ; leurs granules se colorent positivement. Les colorations immunohistochimiques "mast cell tryptase" et "CD 117" sont également utilisées pour détecter les mastocytes. L'urticaire et l'urticaire pigmentaire font partie des entités pathologiques marquées par une augmentation significative du volume des mastocytes, et le Giemsa trouve donc son utilité dans ce cas. La coloration positive de plusieurs organismes infectieux, notamment les spirochètes, les protozoaires et la Leishmaniose cutanée, contribue également à la valeur de Giemsa. La première utilisation d'une solution de coloration contenant du bleu de méthylène (un colorant thiazine cationique) et de l'éosine (un colorant xanthène rouge anionique) a probablement été faite en 1888 par C. Chenzinsky, pour colorer des parasites de la malaria dans des films sanguins. F. Plehn en 1890 et E. Malachowski et D. L. Romanowsky en 1891 ont tous décrit indépendamment des solutions de coloration similaires qui conféraient une variété de couleurs aux érythrocytes, aux leucocytes et aux parasites du paludisme.