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El mercurio es uno de los metales pesados que provoca la inhibición del transporte de electrones en la fotosíntesis en múltiples sitios entre los dos fotosistemas, el PS-II es más sensible que el PS-I. El mercurio a baja concentración causa alteraciones en la absorción así como en las propiedades espectrales de fluorescencia y afecta a la transferencia de energía desde el ficobilsoma al centro de reacción. Durante la incubación a corto plazo, altera la interacción entre el cromóforo y el apoproteína de la ficocianina. Mientras que la incubación a largo plazo conduce a la degradación de la subunidad ¿ de la ficocianina