A radiação UV-B atinge a terra devido ao empobrecimento da camada de ozono e afecta tanto o ambiente terrestre como aquático. A fotossíntese em cianobactérias é propensa à radiação UV-B e é alterada. Principalmente nas cianobactérias, particularmente nas PS-II, é susceptível à radiação UV-B e a transferência de energia é alterada. Além disso, as cianobactérias adaptam vários mecanismos de defesa como a indução de actividades enzimáticas antioxidantes para limpar os radicais livres formados para proteger o sistema de danos.