O mercúrio é um dos metais pesados que causam inibição no transporte fotossintético de electrões em múltiplos locais entre os dois fotossistemas, o PS-II é mais sensível do que o do PS-I. O mercúrio em baixa concentração causa alterações na absorção, bem como propriedades espectrais de fluorescência e afecta a transferência de energia do Phycobilsome para o centro de reacção. Durante a incubação a curto prazo, altera a interacção entre o cromóforo e o apo-protien de fitocianina. Enquanto que a incubação a longo prazo leva à degradação do ¿-subunit de ficocianina