La manutenzione delle protesi complete è un ruolo che deve essere svolto dal paziente. È stato stabilito che due minuti di irradiazione a microonde a 650 Watt forniscono la disinfezione della protesi e tre minuti la sterilizzazione. Non ci sono dati sufficienti su come questa pratica influisca sulla stabilità dimensionale a lungo termine delle basi delle protesi complete comunemente utilizzate negli Stati Uniti. La contaminazione delle protesi rimovibili con microrganismi (ad esempio batteri, funghi o virus) le trasforma in fonti di rischio di infezione che possono colpire i portatori di protesi e gli odontoiatri. È indispensabile che tali protesi siano disinfettate, presso lo studio odontoiatrico o il laboratorio, per ridurre i rischi di contaminazione crociata e per rispettare le linee guida sul controllo delle infezioni. Sono stati suggeriti diversi metodi di disinfezione, tra cui l'immersione delle protesi in soluzioni chimiche di ipoclorito di sodio, glutaraldeide alcalina, clorexidina al 4%, biossido di cloro e detergenti per protesi come i perossidi alcalini, la terapia erboristica e fotodinamica.