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El Sistema Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación argentino está compuesto por un conjunto variado de instituciones que realizan actividades de investigación y desarrollo, formación de recursos humanos, divulgación, innovación y/o transferencia. Dichas instituciones varían en su perfil, trayectoria, tamaño y alcance territorial. Una complejidad adicional consiste en que dependen de distintas áreas de gobierno. Esta situación representa un desafío a la hora de diseñar políticas públicas de ciencia, tecnología e innovación. En este libro se realiza un breve recorrido que se extiende desde el ingreso de la evaluación de las instituciones de I+D en la agenda pública hasta su implementación con la creación del Programa de Evaluación Institucional (PEI). El trayecto se completa con un análisis crítico de las principales dificultades detectadas y mejoras alcanzadas por las universidades nacionales en dos dimensiones: la planificación estratégica de la I+D y la vinculación con el entorno. Las conclusiones pueden significar un aporte para los actores que integran el SNCTI, para el propio PEI y para experiencias similares en otros países.