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Las archaea humanas endosimbióticas y colónicas secretan virus de ARN y ADN y sirven de reservorio para ellos. Las archaeas secretan virus envueltos como el SARS, MERS, corona y VIH. El proceso de secreción de los virus arqueológicos es el mismo que el de los virus envueltos como el SARS, MERS y Corona. Los murciélagos sirven como reservorio para los virus como el SARS, MERS y Corona. Los murciélagos contienen archaeas que pueden secretar viroides de ARN y generar virus. Las archaea colónicas y endosimbióticas también generan viroides de ARN que se convierten en viroides de ADN por la transcriptasa inversa del HERV epitelial colónico y se integran en el genoma colónico. Los viroides de ARN y ADN se hibridan con la población viroide y bacteriana del microbioma intestinal y el ADN y ARN del virobioma intestinal, lo que da lugar a la generación de nuevos virus emergentes. Los viroides de ARN y ADN y las bacterias del intestino también pueden hibridarse con las secuencias genómicas humanas y las secuencias HERV de la célula epitelial colonial. La hibridación de los viroides de ARN archaeal con las secuencias genómicas humanas de HERV puede generar retrovirus.
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