El control interno cada día gana más protagonismo en la Administración Pública brasileña, la búsqueda de la transparencia en la prestación de los servicios públicos en su conjunto, unido a la necesidad de austeridad en el gasto de la administración pública señalan el camino para la mejora de la gestión y la responsabilidad en el gasto público. El control externo junto con el control interno, complementado por el control social, unen esfuerzos para promover una gestión pública más eficiente y eficaz, con el objetivo de rendir cuentas al pueblo, titular del Poder Público y contribuyente directo que apoya el marco administrativo del Estado. Las auditorías internas, como órganos capaces de evaluar los controles internos, desempeñan un importante papel en el sistema de control de la Administración Pública, por lo que merecen la distinción que se hace en este trabajo. La investigación tuvo como objetivo analizar la actividad de auditoría interna en una Institución Educativa Federal, proponiendo mejoras para apoyar la gestión, la mejora de los controles internos y el apoyo a la toma de decisiones.