Eléments transposables et gènes d''hôte
Analyse comparative de séquences chez cinq espèces eucaryotes
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Les éléments transposables (ET) sont présents chez tous les organismes vivants et sont impliqués dans un grand nombre de mutations et de réarrangements chromosomiques. Ils représentent des composants majeurs des génomes et sont intimement liés à leur évolution. Afin de tester si les ET sont soumis aux mêmes contraintes que les gènes d'hôte, nous avons comparé l'usage des codons des ET à celui des gènes d'hôte chez cinq espèces: l'arabette, le nématode, la drosophile, l'homme et la levure. Les résultats montrent que les ET sont riches en AT quelle que soit l'espèce hôte: i...
Les éléments transposables (ET) sont présents chez tous les organismes vivants et sont impliqués dans un grand nombre de mutations et de réarrangements chromosomiques. Ils représentent des composants majeurs des génomes et sont intimement liés à leur évolution. Afin de tester si les ET sont soumis aux mêmes contraintes que les gènes d'hôte, nous avons comparé l'usage des codons des ET à celui des gènes d'hôte chez cinq espèces: l'arabette, le nématode, la drosophile, l'homme et la levure. Les résultats montrent que les ET sont riches en AT quelle que soit l'espèce hôte: il s'agit donc d'une propriété intrinsèque aux ET. L'analyse de la composition en bases aux différentes positions des codons montre que les ET sont aussi soumis à de la sélection. De plus, les ET semblent posséder un pattern d'expression particulier. L'analyse de l'abondance relative en di- / tri-nucléotides montre que les ET possèdent un pattern similaire à celui de leur hôte. Ce travail suggère un comportement spécifique des ET qui semblent soumis à des contraintes de sélection particulières permettant le maintien de leur richesse en AT.
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