I microrganismi e gli insetti sono i due gruppi di organismi di maggior successo sulla terra. Gli onnipresenti microbi sono presenti anche all'interno del corpo degli insetti in stretta associazione e sono noti come endosimbionti. Tra i vari endosimbionti presenti negli insetti, i batteri sono quelli che svolgono i ruoli più diversi. Solo meno dell'uno per cento degli endosimbionti degli insetti sono coltivabili e le tecniche di sequenziamento di nuova generazione come Illumina, Ion Torrent, Roche 454 pyrosequencing ecc. possono essere utilizzate per l'individuazione di specie non coltivabili.
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