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La matière organique est l'un des principaux éléments du système de production de conservation. La matière organique du sol est chargée de contribuer efficacement aux attributs physiques, chimiques et biologiques des sols. Physique parce que le MOS améliore la structure du sol ; chimique parce qu'il rend les ions disponibles pour la solution du sol, en plus de contribuer à l'amélioration de la qualité du sol.Physique, car la SOM améliore la structure du sol ; chimique, car elle rend les ions disponibles à la solution du sol, tout en contribuant à la teneur en carbone organique et à la CEC (capacité d'échange cationique) ; et biologique, car elle améliore l'activité microbienne du sol. Constitué de 58% de carbone organique (Corg), il peut être incorporé au sol par le biais de systèmes de production conservationnistes, dont le plus connu est le système de plantation directe (SDP). D'autres stratégies telles que le chaulage et l'engrais vertaugmenter la teneur en MOS. La matière organique est cruciale dans une gestion conservationniste des ressources naturelles.