As bactérias encerradas no biofilme são extremamente resistentes aos tratamentos antibióticos; tal resistência pode ser explicada por hipóteses, não necessariamente limitadas às seguintes. Primeiro, a bactéria bibiofilme secretada pelo EPS, age como uma barreira física/química, impedindo assim a penetração de anticorpos ou muitos antibióticos. O EPS é carregado negativamente e funciona como uma resina de troca iônica capaz de ligar um grande número de moléculas antibióticas que estão tentando alcançar as células de biofilme embutidas. Em segundo lugar, as bactérias do biofilme embutido geralmente não estão ativamente envolvidas na divisão celular, são menores em tamanho e menos permeáveis aos antibióticos. Nós demonstramos aqui pela primeira vez que as culturas de biofilme de aMycobacterium são capazes de crescer em concentrações mais altas de medicamentos (ou seja, têm MICs mais altas) do que as culturas de suspensão. A concentração de MIC de fármacos selecionados que inibiram o crescimento exponencial do biofilme foi considerada maior do que a MIC para a cultura planctônica. A literatura do biofilme oferece essencialmente três explicações possíveis para a resistência aos fármacos associados ao biofilme: (i) Crescimento mais lento do biofilme, (ii) Diminuição da penetração de drogas no biofilme devido à arquitetura e/ou e
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