Las bacterias encerradas en el biofilm son extremadamente resistentes a los tratamientos con antibióticos; dicha resistencia puede explicarse con hipótesis, no necesariamente limitadas a las siguientes. En primer lugar, la bacteria EPS secretada por el biofilm, actúa como una barrera física/química, impidiendo así la penetración de anticuerpos o muchos antibióticos. El EPS está cargado negativamente y funciona como una resina de intercambio de iones que es capaz de unir un gran número de las moléculas de antibióticos que intentan llegar a las biopelículas incrustadas. En segundo lugar, las bacterias de las biopelículas incrustadas no suelen participar activamente en la división celular, son de menor tamaño y menos permeables a los antibióticos. Demostramos aquí por primera vez que los cultivos de biopelículas de aMycobacterium son capaces de crecer a mayores concentraciones de drogas (es decir, tienen mayores CMI) que los cultivos de suspensión. La CMI de la concentración de los medicamentos seleccionados que inhibieron el crecimiento exponencial de la biopelícula se encontró que era mayor que la CMI para el cultivo de plancton. La literatura sobre biopelículas ofrece esencialmente tres posibles explicaciones para la resistencia a los fármacos asociada a las biopelículas: (i) Crecimiento más lento de la biopelícula, (ii) Disminución de la penetración del fármaco en la biopelícula debido a la arquitectura y/o e
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