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Genetische und epigenetische Faktoren werden häufig bei HCC beobachtet. Das epigenetische System hat zwei Flügel, von denen einer die epigenetischen Prozesse wie DNA-Methylierung und Histonmodifikation ist, der zweite sind epigenetische Faktoren, die es in zwei Arten gibt, nämlich interne Faktoren wie nichtkodierende RNA (ncRNA) und externe Faktoren wie Nahrungsmittelprävention. Alle diese Faktoren sind mit dem Fortschreiten und der Metastasierung von HCC verbunden.