O termo análise estrutural deve ser utilizado para se referir a equações inovadoras de espectrometria de massa de dinâmica estocástica utilizadas para determinar estruturas moleculares tridimensionais de metabolitos de cafeína e prever teoricamente os seus espectros de massa. O estudo examina a cafeína; ácido úrico, ácido 1-metil-, 1,2-, 1,7- e 3,7-dimetil-úrico; xantina; 1-, 3- e 7-metil-xantina; para- e hidroxi-xantinas; teacrina; teobromina; guanina; timina; e teofilina, respectivamente. Ele emprega espectrometria de massa de ionização por eletrospray de ultra-alta resolução e espectrometria de mobilidade iônica; métodos estáticos de química quântica de alta precisão e dinâmica molecular baseados na teoria ab initio e do funcional de densidade. A quimiometria avalia o grau de correspondência estatística entre dados observáveis e teóricos nessas equações e mensurandos do analito.