A partir de una revisión bibliográfica de la sociología de la profesión médica y de estudios internacionales sobre la implementación de Guías Clínicas, se desarrolla un estudio cualitativo con entrevistas a médicos clínicos chilenos respecto al uso de Guías Clínicas y Canastas de Prestaciones de la Reforma al Sistema de Salud (AUGE-GES). La Reforma busca establecer garantías explícitas para la atención de pacientes en Chile, estableciendo estándares nacionales de calidad en la prestación de salud. En general, los médicos siguen sugerencias sólo si coinciden con su propio criterio y se resisten a cambiar su práctica clínica sobre la base de consideraciones abstractas. El juramento hipocrático obliga a los médicos a poner el bienestar del paciente por encima de otras consideraciones, especialmente económicas. La aceptación de la estandarización de los procesos clínicos varía de acuerdo a los años de experiencia y el tipo de formación. Médicos jóvenes tienden a confiar más en la evidencia, aunque el criterio profesional es transversalmente respetado. Instrumentos de estandarización con criterios de control de costos obtienen la menor aceptación en la comunidad médica chilena.