Normalmente, los biosensores se utilizan para detectar una molécula específica de interés. En los últimos tiempos, la búsqueda de la nueva diana mediante estos biosensores se ha utilizado en procesos como el descubrimiento de fármacos, receptores, cuantificación de la toxicidad de los contaminantes, etc. Teóricamente, es posible diseñar la proteína para obtener el tipo deseado de biosensores de proteína que tengan afinidad con la detección de la nueva diana, y esto se puede hacer ya sea en biosensores basados en genéricos o en una nueva proteína en conjunto. En este contexto, el procedimiento de diseño computacional produce datos más fiables que mejoran el diseño de la proteína. Aplicando las estrategias de reordenación o diseño molecular en la proteína, es posible construir un biosensor novedoso.
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