Desde finales de la década de 1980, el comportamiento del mercurio en el medio ambiente amazónico y su toxicidad han sido discutidos en un intento de determinar el verdadero riesgo que este elemento representa para el ecosistema. En el medio acuático, el mercurio puede ser metilado por procesos biológicos y/o químicos. Entre las especies de mercurio, el metilmercurio (MeHg) es la más tóxica, lo que se debe a su gran estabilidad, solubilidad en lípidos y propiedades iónicas que le permiten atravesar las membranas de los organismos vivos. La metilación y acumulación de mercurio en la biota es mayor en el medio acuático y puede considerarse el paso clave para entender su ciclo. El interés en el estudio ecotoxicológico del MeHg se debe a que es una neurotoxina, teniendo la tendencia a bioacumularse y biomagnificarse, convirtiéndose en un riesgo para la salud humana. En este estudio se realizó un estudio en la región del río Madeira en el área de influencia de la Central Hidroeléctrica de Jirau, determinando la concentración de mercurio total y orgánico en muestras de agua, suelo y sedimentos, encontrándose que estos valores están por debajo de los niveles recomendados por la legislación brasileña, no mostrando evidencia de contaminación.
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