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Entre los animales de ganadería de la India, los bovinos y los búfalos son muy importantes y contribuyen en gran medida a las industrias ganaderas y, a su vez, a la economía del país. Se están llevando a cabo varios programas de mejora genómica en todo el país para la mejora de las razas de vacuno y búfalo. La secuenciación del genoma de ambas especies está casi terminada. Aunque el genoma del ganado vacuno está bien terminado, el del búfalo sólo está redactado y además con una cobertura muy reducida. Del genoma inacabado del búfalo, es muy necesario averiguar los genes de importancia agrícola. Esto sólo es posible anotando su genoma mediante un análisis comparativo con el genoma bien terminado de la vaca, un miembro de su propia familia. Hoy en día, los navegadores del genoma son muy populares en el campo de la anotación del genoma al facilitar la visualización gráfica de los elementos genómicos en el genoma y la comparación del genoma de dos o más organismos.