La citología cromosómica ha sido más utilizada por los citogenetistas animales que por los biólogos moleculares. El cariotipo de cada especie individual se caracteriza por el número de cromosomas, el tamaño y la morfología, y es fijo y específico para cada especie. El número y la forma de las bandas cromosómicas pueden determinarse utilizando diversas técnicas de disección y tinción. La taxonomía cromosómica puede ser muy útil tanto para determinar las relaciones filogenéticas de los taxones como para detectar la variación estructural de las especies crípticas. El estudio incluye el mapeo físico de los cromosomas, especialmente en el mapeo cromosómico comparativo con una variación mínima entre los individuos. Los números de cromosomas diploides específicos de cada especie (2n) se determinan principalmente utilizando la propagación de la mitosis y la posición del centrómero, y desempeña un papel importante en la caracterización taxonómica del individuo. Los métodos de tinción recientes son los posibles marcadores para sondear el patrón específico de bandas a lo largo de la longitud de un cromosoma y, por consiguiente, puede ser útil para la visualización directa de un segmento específico de cromosomas en los núcleos interfásicos.
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