En este estudio, confirmamos la presencia de tres serotipos del virus de la fiebre aftosa (A, O, SAT2) que circulan en las provincias egipcias e indicamos la prevalencia del virus de la fiebre aftosa de reciente aparición. Asimismo, estudiamos la caracterización molecular del virus y la relación epidemiológica entre los virus del mismo serotipo para detectar movimientos transfronterizos del VFA que revelan la circulación de diferentes serotipos y topotipos en Egipto (O-EA3, A- Irán-05 y SAT2- VII topotipos).La secuencia de nucleótidos del gen Vp1 y el análisis filogenético confirmaron la presencia del topotipo O- EA-3 (East Africa-3), estrechamente relacionado con los aislados egipcios recientes, pero con una gran divergencia de nucleótidos respecto a la cepa vacunal utilizada, con una diferencia de nucleótidos del 15%,Por lo tanto, es necesario investigar la protección cruzada entre las cepas detectadas y la vacuna utilizada actualmente para garantizar la máxima protección contra la enfermedad y el virus circulante, así como realizar más estudios sobre la relación inmunogénica y los caracteres antigénicos entre los serotipos del virus de la fiebre aftosa y la cepa vacunal utilizada para el control de la enfermedad, con un seguimiento continuo de la variabilidad de la secuencia nucleotídica de los serotipos.
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