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Entre os animais de gado na Índia, o gado e os búfalos são altamente importantes que contribuem muito para as indústrias de gado e, por sua vez, para a economia do país. Vários programas de melhoramento genómico estão a ser levados a cabo em todo o país para o melhoramento das raças de gado bovino e búfalo. A sequenciação genómica de ambas as espécies está quase completa. Embora o genoma bovino esteja bem acabado, o genoma do búfalo está apenas redigido e isso com uma cobertura muito pequena. A partir do genoma inacabado dos búfalos, é altamente necessário descobrir os genes importantes para a agricultura. Isto só é possível anotando o seu genoma através de uma análise comparativa com o genoma de vaca bem acabado, um membro da sua própria família. Actualmente, os navegadores de genoma são muito populares no campo da anotação do genoma, facilitando a visualização gráfica de elementos genómicos sobre o genoma e a comparação do genoma de dois ou mais organismos.
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