Neste estudo, confirmamos a presença de três serótipos (A, O, SAT2) de FMDV em circulação nas províncias egípcias e indicamos a prevalência da recém emergida FMDV. Também estudamos a caracterização molecular do vírus e a relação epidemiológica entre vírus do mesmo sorotipo para detectar movimentos transfronteiriços da FMDV que revelam a circulação de diferentes serótipos e topótipos no Egito (topótipos O-EA3, A- Iran-05 e SAT2- VII).A sequência nucleotídica do gene Vp1 e a análise filogenética confirmaram a presença do topótipo O- EA-3 (África Oriental - 3) que estava intimamente relacionado com os recentes isolados egípcios, mas com elevada divergência nucleotídica em relação à estirpe vacinal utilizada por 15% de diferença nucleotídica,Assim, é necessário investigar a protecção cruzada entre as estirpes detectadas e a vacina actualmente utilizada para garantir a máxima protecção contra a doença e o vírus circulante e mais estudos sobre a relação imunogénica e os caracteres antigénicos entre os serótipos da FMDV e a estirpe vacinal utilizada para o controlo da doença, com um acompanhamento contínuo da variabilidade da sequência dos serótipos nucleótidos.