A maioria das doenças das plantas são causadas por organismos bióticos, ou vivos. Muitos organismos diferentes, incluindo fungos, bactérias, fitoplasmas, vírus e viroides, nemátodos, e plantas parasitárias superiores, são responsáveis pela maioria das doenças das plantas. As doenças induzidas por causas abióticas não são contagiosas por natureza. Há quase um número infinito de factores que podem provocar uma perturbação; no entanto, a maioria das perturbações são provocadas por um punhado de factores, incluindo extremos na temperatura, humidade, luz, níveis de nutrientes, solo pobre (acidez ou alcalinidade, sal, textura), toxicidade dos pesticidas, poluição do ar, ventos fortes, granizo, e práticas culturais impróprias. São especialmente susceptíveis aos danos causados por ataques de insectos e à competição que vem de plantas que não são desejáveis (ervas daninhas). No entanto, os danos vegetais que são causados por insectos, pessoas, ou outros animais, muitas vezes não fazem parte do objecto das investigações de patologia vegetal.
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