Face aux difficultés que rencontrent la carpiculture et la tilapiaculture à Madagascar, la question se pose de savoir s'il existe des parasites digestifs chez la carpe et le tilapia. Ainsi, l'objectif de ce travail est de rechercher ces parasites et d'en déterminer les facteurs de risques potentiels. Nous avons effectué une étude prospective et transversale sur 268 poissons, dans 34 milieux d'élevage, répartis dans 5 régions. Au terme de nos travaux, force est de constater que l'infestation existe chez les poissons avec une prévalence de 33% et dans les sites élevages avec une prévalence élevée (76%). On retrouve quatre groupes parasitaires et des cas d'associations parasitaires. L'étude des facteurs de risques montre que le risque d'infestation des poissons varie selon la région. Des moyens de lutte peuvent être proposés, des séances vulgarisations auprès des populations sur les conduites d'élevages devraient pouvoir réduire les prévalences d'infestation.