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La eliminación de nitrógeno puede llegar hasta el 90% en efluentes de desagües secundarios y el nitrógeno así extraído, puede preservarse en el suelo mismo o dispersarse en la atmósfera a partir de procesos tales como, la adsorción de iones amónicos, fijación por materia orgánica, la incorporación al protoplasma microbiano, la desnitrificación biológica y volatilización amónica por aereación. En la región de estudio se caracterizó fisicoquimicamente; en épocas seca, de transición y húmeda;las aguas subterráneas considerando parámetros de campo, aniones y cationes mayoritarios y principalmente nitrógeno en las formas nitrógeno total, orgánico, inorgánico (nitrato, nitrito y amonio). Se determinó que en los pozos perforados y excavados de la zona, se encuentran contaminados con altas concentraciones de amonio (límite permisible de agua potable de O.M.S. de 0,05 mgL-1) producto de la descomposición bacteriana del nitrógeno orgánico aportado mediante los efluentes de pozos sépticos ylavado de los depósitos de estiércol en época de lluvias. Se empleó herramientas de Sistemas de Información geográfica (SIG) para la evaluación de la distribución espacial del trabajo descrito.