La calidad del agua se está alterando por las actividades humanas. El nitrógeno y el fósforo que se produce ha incrementado el desarrollo del proceso de eutrofización en el ambiente costero. Yucatán, México, es una zona tropical con un alto desarrollo económico que está cambiando la costa, por el crecimiento de la población. Las fuentes de nutrimentos de Yucatán, son en orden de importancia, la porcicultura y avicultura, la agricultura, la precipitación atmosférica y los desechos de origen humano. El subsuelo es un sistema cárstico de carbonato de calcio que favorece la infiltración del agua y de contaminantes, que se integran al agua subterránea y que desemboca en la costa con un volumen similar al de los ríos, y es una fuente de nitrógeno y silicio. El fósforo probablemente es el nutrimento limitante de la producción primaria. El gradiente de salinidad, los pastos marinos y los procesos biogeoquímicos del sedimento, pueden ser los atributos del ambiente costero de Yucatán que actúan como el filtro del modelo contemporáneo de eutrofización costera, que modula las respuestas del ecosistema al estímulo del aporte de nutrimentos.