El presente estudio se realizó en el Laboratorio de Biotecnología de la Unidad de Investigación Científica y Tecnológica de la Universidad Técnica Estatal de Quevedo, ubicado en el Km, 1,5 vía Quevedo - Santo Domingo. El propósito de la investigación consistió en establecer un protocolo de extracción de ADN de cacao de tipo Nacional. Se seleccionaron 30 accesiones de cacao de tipo Nacional con características de productividad y tolerancia a enfermedades, a partir hojas sanas de cacao en estado intermedio de madurez. Para la extracción de ADN, se probaron tres tratamientos T1 Protocolo de extracción de ADN en cacao propuesto por Doyle y Doyle (1990) modificado, T2 Protocolo de extracción de ADN en cacao propuesto por Colombo et al. (1998), T3 Protocolo de extracción de ADN en cacao propuesto por Uyemoto et al. (1998).