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Les fibres alimentaires peuvent affecter le fonctionnement de l'organisme et des cellules. Une carence en fibres alimentaires entraîne une digestion prédominante dans l'intestin grêle et un excès de fibres alimentaires entraîne une digestion dans le côlon. La digestion de l'intestin grêle en présence d'une carence en fibres alimentaires entraîne une altération de la flore colique et une prolifération d'archées. Un régime riche en fibres produit une digestion colique prédominante et entraîne la suppression de la croissance des archées. Les archées coliques traversent la barrière sanguine de l'intestin et produisent une endosymbiose archéale. Ainsi, la digestion de l'intestin grêle due à une carence en fibres alimentaires et la digestion du côlon due à un excès de fibres alimentaires déterminent la densité des archées dans le côlon ainsi que le compartiment endosymbiotique. Une carence en fibres alimentaires peut entraîner une augmentation de la croissance des archées endosymbiotiques et coliques. Les fibres alimentaires sont le composant le plus important de l'alimentation humaine, plus important que les protéines alimentaires, les graisses, les glucides, les vitamines et les minéraux. Les fibres alimentaires sont le substrat qui détermine la symbiose et l'évolution symbiotique.