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No presente trabalho são apresentadas a composição e características ecológicas (riqueza, diversidade, densidade celular e biomassa de carbono) da comunidade fitoplanctônica, investigando a ocorrência de microalgas potencialmente nocivas e a influências dos fatores ambientais, em áreas de cultivo de ostras na Baía de Camamu, Bahia-Brasil. O microfitoplâncton esteve composto por 79 táxons, apresentando diversidades típicas de regiões costeiras oligotróficas.