In biologia, un ceppo è una variante genetica, un sottotipo o una coltura all'interno di una specie biologica. I ceppi sono spesso considerati concetti intrinsecamente artificiali, caratterizzati da uno specifico intento di isolamento genetico, come si può osservare più facilmente in microbiologia, dove i ceppi derivano da una colonia monocellulare e sono tipicamente messi in quarantena dai vincoli fisici di una piastra di Petri. Si parla comunemente di ceppi anche nell'ambito della virologia, della botanica e dei roditori utilizzati negli studi sperimentali.