Les médicaments hydrophobes administrés par voie orale rencontrent des problèmes de perméabilité et donc de biodisponibilité. Ils subissent une dégradation chimique et enzymatique dans le tractus gastro-intestinal et présentent un métabolisme de premier passage hépatique important. De même, divers autres facteurs entravent la découverte de médicaments et la mise au point d'un mode d'administration efficace de différentes molécules thérapeutiques. La thymoquinone (THQ), un composant lipophile actif majeur de Nigella Sativa (Ranunculaceae), a été rapportée comme ayant de nombreuses qualités pharmacologiques telles que ses effets immu-nomodulateurs, anticancéreux, anti-inflammatoires et antioxydants. La caractérisation physico-chimique du THQ a été effectuée sur la base des propriétés organoleptiques, de la solubilité, de la perte au séchage, du coefficient de partage, de la spectroscopie IR et de la calorimétrie différentielle à balayage. Sur la base de ces tests, l'échantillon de médicament THQ s'est avéré authentique et pur. Une méthode analytique utilisant RP-HPLC a été développée et validée pour déterminer la libération in vitro et l'étude de perméation. Des nanoparticules de chitosan (NP) ont été préparées selon la méthode de gélification ionique.