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Los resultados del experimento de fertilización a largo plazo en el sistema soja-trigo indicaron que todas las fracciones de N se incrementaron tanto en las capas superficiales como en las sub-superficiales del suelo con la aplicación continua de N fertilizante y FYM. El uso equilibrado de nutrientes (100% NPK) y su aplicación integrada con FYM (100% NPK+FYM) mejoraron el contenido de N y sus fracciones en el suelo. Sin embargo, el cultivo continuo sin fertilización y/o el uso desequilibrado de nutrientes (100% N solo) resultó perjudicial para la salud del suelo, ya que dio lugar a un marcado agotamiento de varias fracciones de N en los suelos superficiales y subsuperficiales. Por lo tanto, la aplicación conjunta de fertilizantes inorgánicos con estiércol orgánico podría ser la mejor opción para mantener a largo plazo la productividad de los cultivos y la fertilidad del suelo en un Vertisol bajo el sistema de cultivo de soja-trigo.