Os resultados do experimento de longo prazo com fertilizantes no sistema soja- trigo indicaram que todas as frações de N foram aumentadas nas camadas superficiais e sub-superficiais do solo com a aplicação contínua de fertilizante N e FYM. O uso equilibrado de nutrientes (100% NPK) e sua aplicação integrada com o FYM (100% NPK+FYM) melhorou o conteúdo de N e suas frações no solo. No entanto, o cultivo contínuo sem fertilização e/ou uso desequilibrado de nutrientes (100% N só) provou ser prejudicial à saúde do solo, uma vez que resultou num esgotamento acentuado de várias fracções de N tanto no solo superficial como sub-superficial. Portanto, a aplicação conjunta de fertilizantes inorgânicos com esterco orgânico poderia ser a melhor opção para sustentar a produtividade das culturas e a fertilidade do solo a longo prazo em um Vertisol sob o sistema de cultivo de trigo-soja.