En biología, una cepa es una variante genética, un subtipo o un cultivo dentro de una especie biológica. Las cepas suelen considerarse conceptos intrínsecamente artificiales, caracterizados por una intención específica de aislamiento genético, lo que se observa más fácilmente en microbiología, donde las cepas se derivan de una colonia unicelular y suelen estar en cuarentena por las limitaciones físicas de una placa de Petri. Las cepas también se denominan comúnmente en virología, botánica y con roedores utilizados en estudios experimentales.
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