Gli agenti patogeni sono batteri, virus, nematodi e funghi. Gli insetti, come gli esseri umani e le piante, possono essere infettati da agenti patogeni che causano malattie. Gli insetti patogeni generalmente uccidono, riducono la riproduzione, rallentano la crescita o accorciano la vita di un insetto parassita. A differenza degli insetticidi chimici, gli insetticidi microbici di solito impiegano più tempo per uccidere o indebolire il parassita bersaglio. Tuttavia, in determinate condizioni, come umidità elevata o popolazioni elevate di parassiti, questi patogeni possono causare epidemie che decimano una popolazione di insetti. Gli agenti patogeni sono più efficaci quando le popolazioni di parassiti sono molto elevate. Gli agenti patogeni sono difficili da gestire perché la loro presenza ed efficacia dipende fortemente da fattori quali temperatura moderata e umidità elevata. Durante la stagione secca, ad esempio, non si vedranno quasi mai afidi uccisi da un fungo, perché questo ha bisogno di un'elevata umidità per sopravvivere e diffondersi. La maggior parte degli agenti patogeni è troppo piccola per essere vista dagli occhi umani. Solo i sintomi che gli agenti patogeni degli insetti causano possono essere visti con gli occhi: ad esempio un insetto morto ricoperto di spore di funghi come "peli" o "polvere" o un insetto morto che è nero e perde liquido dal corpo.