Trichoderma is een geslacht van schimmels in de familie Hypocreaceae dat in alle grondsoorten voorkomt en is de meest voorkomende kweekbare schimmel. Ze komen wereldwijd voor en kunnen gemakkelijk geïsoleerd worden uit de bodem, organisch plantaardig materiaal, rottend hout enz. Het is een bekende agressieve biocontroleagent en heeft een hoger potentieel voor reproductie en kolonisatie. In deze studie werd de genetische diversiteit onder veertien Trichoderma-isolaten (TBT- 01 tot TBT- 14) geëvalueerd met behulp van tien SSR-markers. Rhizosferische bodemmonsters van verschillende locaties in Uttar Pradesh werden verzameld en onderworpen aan seriële verdunning en uitplating op een Trichoderma Selective Media. De kolonies van de isolaten werden puur gekweekt op Potato Dextrose Agar voor DNA-isolatie en moleculair onderzoek. Tien SSR-primers (SSR-01, SSR- 06, SSR- 08, SSR- 10, SSR- 11, SSR-13, SSR- 14, SSR- 15, SSR- 18 en SSR- 20) werden gebruikt voor de PCR-amplificatie van het geïsoleerde DNA.