Reis (Oryza sativa) ist die wichtigste Nahrungspflanze der Welt und eine Hauptnahrungsquelle für mehr als ein Drittel der Weltbevölkerung.Indien ist eines der ursprünglichen Zentren des Reisanbaus. Die Reisanbaufläche in Indien ist die größte der Welt. Indien verfügt über einen immensen Reichtum an aromatischem Reiskeimplasma und Landrassen, die eine große Variabilität hinsichtlich ihrer morphophysiologischen, agronomischen, körnigen und kulinarischen Eigenschaften aufweisen. Molekulare Marker werden im Allgemeinen in (i) Hybridisierungsmarker (ohne PCR) und (ii) PCR-basierte Marker unterteilt. Hybridisierungsbasierte Marker beinhalten einen Restriktionsverdau und die Hybridisierung der eingeschränkten DNA-Fragmente mit einer markierten Sonde, wie z.B. bei RFLPs und VNTRs, während PCR-basierte Marker die Amplifikation von isolierter DNA beinhalten. ). Diese PCR-basierten Marker sind technisch einfach und erfordern nur eine geringe Menge an DNA.