Genetische Vielfalt in beliebten Reissorten Indiens
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Die genetische Vielfalt von 25 verbesserten Sorten und vier traditionellen Sorten wurde mit Hilfe eines Satzes von 20 gut ausgewählten und polymorphen Mikrosatelliten-(SSR-)Primerpaaren charakterisiert. Die verwendeten SSR-Marker waren polymorph (100,0%) und lieferten zuverlässige Informationen über die Verwandtschaft der Sorten. Hohe Werte des Polymorphismus, die bei der Charakterisierung erzielt wurden, wurden der Hypervariabilität der Mikrosatelliten-Marker zugeschrieben. Bei den populären Sorten wurde eine mittlere genetische Ähnlichkeit von 0,38 beobachtet, was auf die große Vielfa...
Die genetische Vielfalt von 25 verbesserten Sorten und vier traditionellen Sorten wurde mit Hilfe eines Satzes von 20 gut ausgewählten und polymorphen Mikrosatelliten-(SSR-)Primerpaaren charakterisiert. Die verwendeten SSR-Marker waren polymorph (100,0%) und lieferten zuverlässige Informationen über die Verwandtschaft der Sorten. Hohe Werte des Polymorphismus, die bei der Charakterisierung erzielt wurden, wurden der Hypervariabilität der Mikrosatelliten-Marker zugeschrieben. Bei den populären Sorten wurde eine mittlere genetische Ähnlichkeit von 0,38 beobachtet, was auf die große Vielfalt der populären Sorten hinweist. Eine Clusteranalyse auf der Grundlage von 87 SSR-Marker-Allelen gruppierte 29 Genotypen in zwei Hauptcluster. Der erste Hauptcluster umfasste 9 Genotypen von traditionellen Sorten und frühen verbesserten Sorten. Der zweite Hauptcluster bestand aus 20 verbesserten Sorten mit komplexem Stammbaum und mehreren Rekombinationsereignissen. Die Hauptkomponentenanalyse ergab vier Cluster, von denen ein Cluster sieben Genotypen aus der Flachlandökologie des Regenfelds enthielt, was darauf schließen lässt, dass die Gruppierung auf physiologischen Merkmalen beruhte. Für 14 Sorten wurden einzigartige Allele generiert, die als molekulare Tags verwendet werden können.
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