Anche le competenze e le preferenze del medico che ha in cura il paziente sono considerazioni importanti. Tutte le lesioni infiammatorie periapicali devono essere trattate inizialmente con procedure conservative non chirurgiche. L'intervento chirurgico è consigliato solo dopo il fallimento delle tecniche non chirurgiche. È stata inoltre riportata un'alta percentuale del 94,4% di guarigione completa e parziale delle lesioni periapicali in seguito a terapia endodontica non chirurgica. Le lesioni specifiche dei bambini dovrebbero essere trattate inizialmente con un approccio non chirurgico, soprattutto quelle che causano meno danni, sia dal punto di vista funzionale che psicologico. Un approccio non chirurgico dovrebbe sempre essere adottato prima di ricorrere alla chirurgia. I vantaggi di un trattamento non chirurgico meno invasivo delle lesioni periapicali estese includono un trauma psicologico minimo e sono più accettabili per i pazienti.