Aunque las infecciones fúngicas participan de forma significativa en la morbilidad y la mortalidad humanas, no se aprecia la eficacia de estas enfermedades en la salud humana. El diagnóstico de las infecciones fúngicas es un reto, especialmente en el huésped inmunodeprimido. Los signos y síntomas son inespecíficos, la colonización es difícil de identificar a partir de la enfermedad invasiva, los hemocultivos suelen ser negativos y los pacientes a menudo no pueden someterse a procedimientos diagnósticos invasivos. El cultivo y el examen microscópico siguen siendo el "patrón de oro", pero no son sensibles. Los ensayos de antígenos, como los sistemas de detección de glucanos y galactomananos, son los más utilizados. Sin embargo, estas pruebas varían en cuanto a sensibilidad y especificidad, dependiendo de la población de pacientes de que se trate. Los ensayos basados en la tecnología molecular aún no están validados clínicamente¿ sin embargo, los avances en la tecnología molecular muestran un gran potencial para la rápida detección e identificación de hongos con fines médicos, científicos y comerciales. Sin embargo, algunos métodos nuevos, como el MALDI-TOF MS, se han convertido en el método estándar para la identificación rutinaria de la mayoría de los organismos microbianos en los laboratorios clínicos y han sustituido en gran medida los ensayos bioquímicos.