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A doca molecular é um método computacional para estudar a formação de complexos intermoleculares de uma pequena molécula ligante (chumbo de droga) com uma macromolécula, que normalmente é uma proteína (alvo de droga) de estrutura tridimensional conhecida. Podem distinguir-se quatro tipos diferentes de interacções entre as moléculas, tais como 1) proteína-proteína; 2) proteína-DNA; 3) ADN-ligante e 4) proteína-ligante. Nos últimos anos, a disponibilidade de estruturas tridimensionais (3D) para muitos alvos de drogas macromoleculares (proteínas) e o rápido avanço da química computacional e bioinformática, tanto in vitro como em silico servem uma nova plataforma para o desenvolvimento, bem como para a exploração de métodos computacionais modernos. Quando a estrutura 3 D do alvo macromolecular é conhecida, então a concepção da biblioteca computacional pode ser personalizada para se adequar à geometria do local de ligação. Além disso, a identificação de sítios de ligação e interacções proteína-ligante utilizando ferramentas bioinformáticas antes de se aventurarem em estudos laboratoriais húmidos poupa consideravelmente a energia, tempo e dinheiro.